Juscimeira abrange uma área territorial de 2.205,018 km2, composta 99% pelo bioma Cerrado e 1% pelo bioma Pantanal. O municípo é reconhecido pelo seu grande manancial termal, abastecido por um dos maiores aquíferos do mundo, o Aquífero Guarani. Seus diversos balneários encontram-se distribuídos em propriedades particulares e oferecem águas naturalmente aquecidas a até 42°C. ​Outros atrativos naturais do município são a cachoeira do Prata, a cachoeira do Bispo (no Distrito de São Lourenço de Fátima) e o lago do São Lourenço. 

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Tanto a sede urbana quanto as principais atividades produtivas desenvolvidas no município - cultivo da soja, milho, algodão, cana de açúcar e criação de bovinos para corte - concentram-se no entorno da microbacia do Córrego Águas Claras, que faz parte da Bacia do Prata e contribui com a Bacia do Rio São Lourenço.​​​ Em seu percurso, o Águas Claras capta água de dois cursos menores, sem denominação e também perenes. Recebe ainda contribuição de canais sazonais em períodos de maior pluviosidade até a sua foz, no terço inferior do rio Areia.

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Entre as décadas de 70 a 90 o córrego Águas Claras foi a principal fonte de abastecimento da cidade de Juscimeira, que hoje conta com um sistema de abastecimento composto por quatro captações subterrâneas (segundo dados do plano Municipal de Saneamento Básico, de 2017): duas delas de uso exclusivo do município e duas particulares, as quais fornecem apenas parte de suas vazões para abastecimento público. 

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De acordo com os dados do Censo 2022, 72,15% da população de Juscimeira recebe água potável via Rede Geral de Distribuição. De modo contrastante, quando observamos o esgotamento sanitário, vemos que apenas 12,6% da população afasta seus esgotos por meio de Rede geral, rede pluvial ou fossa ligada à rede; 19,92% utilizam fossa séptica ou fossa filtro não ligada à rede; e 67,22% afastam seus esgotos utilizando uma fossa rudimentar, ou buraco.

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O clima da região é caracterizado como tropical quente e sub-úmido, com 4 meses de seca de maio a agosto. A precipitação média anual é de 1.750 mm, com intensidade máxima em dezembro, janeiro e fevereiro. Juscimeira faz divisa com os municípios de Rondonópolis, Jaciara, Poxoréo, Santo Antônio de Leverger e São Pedro da Cipa.

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Referências:

https://cidades.ibge.gov.br/brasil/mt/juscimeira/panorama

https://www.aguaesaneamento.org.br/municipios-e-saneamento/mt/juscimeira

https://www.caravela.info/regional/juscimeira---mt#

https://www.juscimeira.mt.gov.br/noticia/9/414/Balnearios-termais-em-Juscimeira-sao-opcoes-para-relaxar-e-curar-o-estresse-no-final-de-semana/

https://persmt.setec.ufmt.br/wp-content/uploads/2020/08/PMSB_Juscimeira.pdf

https://www.juscimeira.mt.gov.br/arquivos/pmsb/Apresentacao-Diagnostico-Juscimeira.pdf 

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